Upravni Odbor upravlja FODK-om i sastoji se od pet članova, koje imenuje Centralna Banka Republike Kosova.
1.Guverner Centralne Banke ili njegov ovlašćeni predstavnik.
2.Jedan predstavnik Ministarstva za Finansije
3.Upravni Direktor FODK-a
4.Jedan (1) stručnjak sa iskustvom u oblasti finansija i osiguranja depozita
5.Jedan (1) stručnjak – ovlašćeni Revizor
Trenutno, Upravni Odbor FODK-a se sastoji od sledećih članova:
1.G. Ahmet Ismaili, Guverner Centralne Banke Republike Kosova
2.G. Vern McKinley, Član (Stručnjak – u oblasti finansija i osiguranja depozita)
3.Gđa. Fetije Ukaj, Član (Stručnjak – Revizor)
4.Gđa. Shqipe Devaja, Član (Generalni Direktora)
